Seemnekottide peamised funktsioonid hõlmavad veekindlust ja tolmukindlust, temperatuuri reguleerimist ja niiskuse säilitamist. Seemnekotid on tavaliselt valmistatud veekindlatest materjalidest, mis võivad niiskuse või vee kotti tungimist tõhusalt ära hoida, vähendada seemnete hallitamise ja mädanemise võimalust ning vältida tolmu kotti langemist, et seemnete puhtuse säilitada. Lisaks sisaldab enamik seemnekotte hügroskoopilisi materjale, näiteks ränidioksiidigeeli, mis aitavad temperatuuri reguleerida seemnete ladustamise ajal ja vältida liiga kõrgeid või madalaid temperatuure, mis ei kahjustaks seemnete kasvuomadusi ja idanemist. Sobiva õhuniiskuse mängib olulist rolli seemnete säilitamisel ja idanemisel. Seemnekotid saavad seemnete niiskust ja idanemiseks abiks seemnete niiskust.

